W sierpniu 2008 roku miała miejsce awaria systemu MultiBanku. W wyniku awarii część przelewów zleconych przez klientów nie dotarła na docelowe rachunki. Przez błąd systemu MultiBanku część przelewów nie została zrealizowana. Dane nadawcy pojawiły się w polu odbiorcy i dlatego część banków zwróciła je powrotem do MultiBanku. To spowodowało, że część banków, do których były one kierowane, zwróciło je z powrotem.– Pan Mateusz Żelechowski z MultiBanku zapewniał, że większość przelewów dotarła na rachunki, gdyż problem dotyczył około 1,2 procenta (1 tys. Przelewów) realizowanych w poniedziałek 11 sierpnia. Po naprawie usterki w systemie MultiBanku do każdego klienta, który wykonywał przelew w dniach awarii wysłano specjalny komunikat w systemie transakcyjnym. Dodatkowo klienci MultiBanku byli informowani o odrzuceniu przelewu telefonicznie przez konsultantów banku. Ponieważ MultiBank nie miał prawa wykonać takiej operacji, klienci musieli powtórnie zlecić przelewy. MultiBank zapewnił, ze zwróci Opłaty za ponowne wykonanie transakcji i ewentualne dodatkowe koszty. Jeśli ktoś spóźnił się z terminowym wypełnieniem swoich zobowiązać wskutek awarii systemu w MultiBanku, po uprzednim złożeniu reklamacji w placówce MultiBanku lub przez multilinię, wówczas bank zobowiązał się pokryć ewentualne straty klientów. Po tym wydarzeniu MultiBank wprowadził zmiany w systemie transakcyjnym, mając na celu poszerzenie jego funkcjonalności. MultiBank dba również o swoją reklamę. W marcu 2009 zaplanowano rozstrzygnięcie przetargu na odpowiednią agencję, która przygotuje kampanię reklamową. Na liście znalazły się cztery agencje. Do ostatniego etapu przetargu została zaproszona agencja BBDO Warszawa, która już teraz współpracuje z MultiBankiem.